Foren / National / Russian / Модули и плагины / создаю свой модуль

Эталонный скин не должен меняться по желанию заказчика. Чем больше будет "ручных" манипуляций - перекинь то, замени это - тем больше будет ошибок.
Применительно к шаблонам:
Если я обновляю плагин, я переписываю заново весь его каталог (включая проверенный рабочий шаблон), а после -- модернизирую tpl из комплекта своего скина. Если я обновляю систему, я переписываю поверх пакет обновлений (который может содержать и обновления в шаблоне админки), а потом, имея возможность "аварийного" переключения на этот самый эталонный шаблон или скин, довожу до ума собственный шаблон / скин админки. А иначе будет балаган: тут меняли, тут не меняли, тут ручками перенесли, а тут случайно поверх записали.
А соглашение по оформлению шаблонов -- вещь нереальная даже в обозримом будущем.