За многоязычность отвечает плагин i18n. Так как все теги указанные вами для хидера смотрим в плагине i18n.header.php. Там есть еще теги, к примеру 'I18N_LANG_ROW_SELECTED' => $lc_selected.
Можно сделать
<!-- BEGIN: I18N_LANG -->
<!-- BEGIN: I18N_LANG_ROW -->
<a href="{I18N_LANG_ROW_URL}" class="{I18N_LANG_ROW_CLASS} " {I18N_LANG_ROW_SELECTED}><img src="images/flags/{I18N_LANG_ROW_FLAG}.png"/></a>
<!-- END: I18N_LANG_ROW -->
<!-- END: I18N_LANG -->
к примеру. Получим что то вроде
<li><a href="/ru/" rel="nofollow" selected=" selected">ru</a></li> только в той локале в которой мы сейчас. Не 100% рабочий код, пробуйте., важно понять принцип формирования всего этого, и искать в нужным местах самому, иначе каждый шаг бцдет долгим.
